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3jcu » PSII-LHCII supercomplex

3jcu » PSII-LHCII supercomplex
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Topology in Thylakoid membrane
Topologythylakoid space side
stroma side
3jcu » PSII-LHCII supercomplex
Hydrophobic Thickness 30.8 ± 0.0 Å
Tilt Angle 0 ± 0°
ΔGtransfer -385.6 kcal/mol
Links to 3jcu PDB Sum, PDB, SCOP, MSD, OCA, MMDB
Topology subunit A (N-terminus stroma)
Resolution 3.2 Å
Other PDB entries representing this structure none
Number of TM Secondary Structures 100
42 transmembrane subunits
A - Tilt: 7° - Segments: 1( 32- 50), 2( 114- 136), 3( 143- 160), 4( 195- 218), 5( 270- 292)
B - Tilt: 4° - Segments: 1( 17- 37), 2( 95- 117), 3( 135- 158), 4( 197- 218), 5( 234- 255), 6( 451- 475)
C - Tilt: 10° - Segments: 1( 47- 70), 2( 112- 133), 3( 155- 177), 4( 235- 253), 5( 269- 289), 6( 426- 449)
D - Tilt: 12° - Segments: 1( 32- 53), 2( 109- 133), 3( 141- 159), 4( 194- 220), 5( 266- 288)
E - Tilt: 13° - Segments: 1( 19- 38)
F - Tilt: 30° - Segments: 1( 18- 42)
G - Tilt: 2° - Segments: 1( 63- 85), 2( 124- 143), 3( 178- 201)
H - Tilt: 16° - Segments: 1( 40- 59)
I - Tilt: 29° - Segments: 1( 3- 25)
J - Tilt: 11° - Segments: 1( 8- 31)
K - Tilt: 29° - Segments: 1( 30- 55)
L - Tilt: 7° - Segments: 1( 15- 34)
M - Tilt: 4° - Segments: 1( 15- 34)
N - Tilt: 3° - Segments: 1( 64- 85), 2( 124- 142), 3( 179- 200)
R - Tilt: 0° - Segments: 1( 94- 116), 2( 144- 163), 3( 196- 218)
S - Tilt: 1° - Segments: 1( 76- 100), 2( 135- 153), 3( 187- 210)
T - Tilt: 18° - Segments: 1( 4- 23)
W - Tilt: 5° - Segments: 1( 103- 124)
X - Tilt: 20° - Segments: 1( 84- 108)
Y - Tilt: 2° - Segments: 1( 63- 85), 2( 124- 143), 3( 178- 201)
Z - Tilt: 19° - Segments: 1( 5- 27), 2( 38- 60)
a - Tilt: 7° - Segments: 1( 32- 50), 2( 114- 136), 3( 143- 160), 4( 195- 218), 5( 270- 292)
b - Tilt: 4° - Segments: 1( 17- 37), 2( 95- 117), 3( 135- 158), 4( 197- 218), 5( 234- 255), 6( 451- 475)
c - Tilt: 10° - Segments: 1( 47- 70), 2( 112- 133), 3( 155- 177), 4( 235- 253), 5( 269- 289), 6( 426- 449)
d - Tilt: 12° - Segments: 1( 32- 53), 2( 109- 133), 3( 141- 159), 4( 194- 220), 5( 266- 288)
e - Tilt: 13° - Segments: 1( 19- 38)
f - Tilt: 30° - Segments: 1( 18- 42)
g - Tilt: 2° - Segments: 1( 63- 85), 2( 124- 143), 3( 178- 201)
h - Tilt: 16° - Segments: 1( 40- 59)
i - Tilt: 29° - Segments: 1( 3- 25)
j - Tilt: 11° - Segments: 1( 8- 31)
k - Tilt: 29° - Segments: 1( 30- 55)
l - Tilt: 7° - Segments: 1( 15- 34)
m - Tilt: 4° - Segments: 1( 15- 34)
n - Tilt: 3° - Segments: 1( 64- 85), 2( 124- 142), 3( 179- 200)
r - Tilt: 0° - Segments: 1( 94- 116), 2( 144- 163), 3( 196- 218)
s - Tilt: 1° - Segments: 1( 76- 100), 2( 135- 153), 3( 187- 210)
t - Tilt: 18° - Segments: 1( 4- 23)
w - Tilt: 5° - Segments: 1( 103- 124)
x - Tilt: 20° - Segments: 1( 84- 108)
y - Tilt: 2° - Segments: 1( 63- 85), 2( 124- 143), 3( 178- 201)
z - Tilt: 19° - Segments: 1( 5- 27), 2( 38- 60)
Comments on 3jcu » PSII-LHCII supercomplex
Unlike for other photosystems, transfer energy here was calculated without heteroatoms.