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5mdx » PSII-LHCII supercomplex

5mdx » PSII-LHCII supercomplex
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Topology in Thylakoid membrane
Topologythylakoid space side
stroma side
5mdx » PSII-LHCII supercomplex
Hydrophobic Thickness 29.4 ± 0.4 Å
Tilt Angle 1 ± 0°
ΔGtransfer -609.5 kcal/mol
Links to 5mdx PDB Sum, PDB, SCOP, MSD, OCA, MMDB
Topology subunit A (N-terminus stroma)
Resolution 5.3 Å
Other PDB entries representing this structure none
Number of TM Secondary Structures 122
48 transmembrane subunits
A - Tilt: 7° - Segments: 1( 38- 50), 2( 114- 132), 3( 143- 160), 4( 195- 217), 5( 274- 292)
B - Tilt: 1° - Segments: 1( 17- 36), 2( 97- 116), 3( 135- 156), 4( 200- 218), 5( 234- 253), 6( 454- 471)
C - Tilt: 11° - Segments: 1( 51- 70), 2( 112- 130), 3( 158- 178), 4( 234- 253), 5( 270- 289), 6( 426- 446)
D - Tilt: 11° - Segments: 1( 33- 54), 2( 110- 131), 3( 142- 160), 4( 195- 217), 5( 270- 288)
E - Tilt: 13° - Segments: 1( 19- 37)
F - Tilt: 31° - Segments: 1( 14- 32)
H - Tilt: 16° - Segments: 1( 40- 59)
I - Tilt: 29° - Segments: 1( 3- 24)
K - Tilt: 32° - Segments: 1( 33- 53)
L - Tilt: 7° - Segments: 1( 15- 33)
M - Tilt: 1° - Segments: 1( 9- 27)
T - Tilt: 14° - Segments: 1( 5- 23)
W - Tilt: 6° - Segments: 1( 99- 117)
X - Tilt: 20° - Segments: 1( 87- 105)
Z - Tilt: 21° - Segments: 1( 3- 24), 2( 42- 59)
a - Tilt: 7° - Segments: 1( 38- 50), 2( 114- 133), 3( 143- 160), 4( 195- 217), 5( 273- 292)
b - Tilt: 8° - Segments: 1( 19- 39), 2( 94- 112), 3( 138- 158), 4( 199- 217), 5( 235- 253), 6( 454- 471)
d - Tilt: 11° - Segments: 1( 33- 54), 2( 113- 131), 3( 142- 160), 4( 195- 218), 5( 270- 288)
e - Tilt: 10° - Segments: 1( 19- 37)
f - Tilt: 33° - Segments: 1( 13- 33)
h - Tilt: 18° - Segments: 1( 40- 59)
i - Tilt: 29° - Segments: 1( 3- 24)
k - Tilt: 31° - Segments: 1( 33- 53)
l - Tilt: 10° - Segments: 1( 15- 33)
m - Tilt: 6° - Segments: 1( 9- 26)
x - Tilt: 22° - Segments: 1( 87- 105)
z - Tilt: 22° - Segments: 1( 3- 24), 2( 42- 59)
w - Tilt: 7° - Segments: 1( 99- 118)
t - Tilt: 14° - Segments: 1( 5- 23)
c - Tilt: 10° - Segments: 1( 50- 70), 2( 113- 130), 3( 158- 177), 4( 235- 253), 5( 268- 287), 6( 426- 446)
R - Tilt: 4° - Segments: 1( 139- 161), 2( 188- 206), 3( 244- 263)
S - Tilt: 4° - Segments: 1( 116- 136), 2( 171- 186), 3( 227- 246)
G - Tilt: 4° - Segments: 1( 101- 122), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
N - Tilt: 1° - Segments: 1( 101- 122), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
Y - Tilt: 3° - Segments: 1( 101- 119), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
r - Tilt: 4° - Segments: 1( 139- 161), 2( 188- 206), 3( 244- 263)
s - Tilt: 4° - Segments: 1( 116- 136), 2( 171- 186), 3( 227- 246)
g - Tilt: 4° - Segments: 1( 101- 122), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
n - Tilt: 1° - Segments: 1( 101- 122), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
y - Tilt: 3° - Segments: 1( 101- 119), 2( 156- 173), 3( 217- 236)
1 - Tilt: 9° - Segments: 1( 98- 119), 2( 156- 174), 3( 214- 235)
2 - Tilt: 1° - Segments: 1( 98- 119), 2( 158- 176), 3( 214- 235)
3 - Tilt: 8° - Segments: 1( 97- 116), 2( 158- 177), 3( 213- 234)
4 - Tilt: 10° - Segments: 1( 97- 122), 2( 143- 161), 3( 224- 244)
5 - Tilt: 9° - Segments: 1( 98- 119), 2( 156- 174), 3( 214- 235)
6 - Tilt: 1° - Segments: 1( 98- 119), 2( 158- 176), 3( 214- 235)
7 - Tilt: 8° - Segments: 1( 97- 116), 2( 158- 177), 3( 213- 234)
8 - Tilt: 10° - Segments: 1( 97- 122), 2( 143- 161), 3( 224- 244)